Ученые обнаружили старейший «почти полный» геном ВИЧ в забытом образце ткани 1966 года

Ученые обнаружили наиболее старый «почти полный» геном ВИЧ в забытом образце ткани 1966 года. Об этом сообщает Live Science со ссылкой на журнал Proceedings of the National Academy of Sciences.

Ученые обнаружили старейший «почти полный» геном ВИЧ в забытом образце ткани 1966 года

Т-клетка, зараженная ВИЧ. Изображение: NIAID

Согласно исследованию, самый старый из известных почти полных геномов штамма ВИЧ был обнаружен в образце ткани из Демократической Республики Конго (ДРК).

Образец был взят в 1966 году, то есть на 10 лет раньше, чем другой «самый старый» геном ВИЧ, полученный из образца крови, взятого в 1976 году в ДРК.

Подобные генные последовательности, появившиеся еще до того, как ВИЧ был обнаружен научным сообществом в 1983 году, помогают точно определить время возникновения генетических мутаций в вирусе, что, в свою очередь, позволяет ученым отслеживать распространение вируса и сроки, когда он передался людям.

Обнаруженный недавно геном 1966 года, по словам исследователей, согласуется с предыдущими данными о сроках появления ВИЧ. То есть, эволюционные модели ученых оказались верны.

Основываясь на генетическом секвенировании образцов вируса, ученые полагают, что последний общий предок ВИЧ появился в начале 1900-х годов (около 1910-го) в Центральной Африке, распространившись от шимпанзе. Существует несколько штаммов вируса, но те, которые ответственны за 95% случаев во всем мире, находятся в подгруппе, называемой ВИЧ-1, группа М. С начала пандемии более 32 миллионов человек умерли от СПИДа — заболевания, вызванного ВИЧ.

Однако то, что произошло почти за 80 лет, прошедших с начала передачи ВИЧ-1 людям и открытием самого вируса, остается загадкой для ученых. Математические модели скорости мутации вируса намекают на то, что ВИЧ рано или поздно должен был перерасти в пандемию. Однако главный вопрос заключается в том, когда и почему группа М ВИЧ-1 стала настолько «успешной», что вышла на глобальный уровень.

Отчасти проблема заключается в том, что модели, которые хорошо рассчитывают скорость вирусных изменений в последние годы, становятся менее надежными в течение более длительных периодов времени. Генетическая информация со временем теряется: штаммы вымирают из-за естественного отбора или просто благодаря удаче, не оставляя следов своего существования в геномах циркулирующих в настоящее время вирусов.

По этой причине обнаружение старого штамма вируса так важно — это словно недостающая часть головоломки, которая помогает заполнить линию эволюционных изменений.

Проект, возглавляемый биологом из Аризонского университета по имени Майкл Воробей (Michael Worobey), проанализировал 1645 образцов биопсии, собранных в Центральной Африке в период с 1958 по 1966 годы для диагностики заболеваний. Используя ПЦР-диагностику (сейчас такое применяют для обнаружения коронавирусной инфекции), исследователи искали намеки на геномы ВИЧ. Они нашли только одно: последовательность из биопсии лимфатических узлов 38-летнего мужчины.

У ученых есть и более старые фрагменты ВИЧ — один из 1959 года и другой из 1960-го, также из ДРК. Но эти фрагменты не настолько полны и потому не могут предложить много информации о мутациях вируса. По словам Гризилса, эти фрагменты были также из разных подтипов ВИЧ, то есть вирус циркулировал в течение некоторого времени среди людей до 1950-х годов.

Следующая цель проекта — выяснить, когда ВИЧ-1 перешел в стадию ускоряющейся эпидемии. Возможно, что некоторые изменения в геноме сделали вирус более заразным, но более вероятно, что большее значение имели социальные изменения. Например, ВИЧ мог начать передаваться во время лечения заболеваний, так как в 1950-е люди еще не могли должным образом стерилизовать иглы. А деколонизация в 1960-х годах могла привести к тому, что люди стали передвигаться или вести себя иначе, чем раньше, что помогло распространению вируса в новых популяциях или более быстрой передаче.

Источник: 42.tut.by